在67种微生物基因组序列中都不存在的最短的碱基组合

• 作者: 李宝健 王强
• 来源期刊: 中山大学研究生学刊：自然科学与医学版
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因组序列 微生物 碱基组合 反向互补序列 寡核苷酸序列 DNA分子 概率
• 年，卷（期）: 2003,（4）
• 页码范围: 44-48
• 页数: 5页
• 分类号: Q523.8

摘要

对67种微生物基因组全序列进行分析，发现某些碱基组合(及其反向互补序列)在某些基因组中不存在，而这种不存在的概率很低；发现6个11bp的寡核苷酸序列(及其反向互补序列)--AGGGGGGGGTC(GACCCCCCCCT)、AGGGTCCCTG(CTAGGGACCCT)、ACGTACCTAGG(CCTAGGTACGT)、GACACACGTAG(CTACGTGTGTC)、CGCGTAACTAG(CTAGTTACGCG)、CTAGGGACCCA(TGGGTCCCTAG)在这67种基因组中都不存在。上述每个寡核苷酸序列(及其反向互补序列)在由这67种细菌基因组连接而成的DNA分子(长度为169660265bp)中不存在的概率至少小于2．5e-26。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王强	中山大学生命科学院基因工程教育部重点实验室	36	238	7.0	15.0
2	李宝健	中山大学生命科学院基因工程教育部重点实验室	50	1229	20.0	34.0