目的:探讨AFP顺式作用元件调控的肝癌特异性减毒超抗原疫苗(SEA(D227A)-Linker-CD80tm)设计的合理性.方法:应用核酸和蛋白质分析软件Gene Construction Kit2.0、ANTHERPRO5.0、JAMBW1.1和www.expasy.com网站提供的方案,分析重组体的开放读框以及融合蛋白的可及性、柔性、抗原性和疏水性,并作了跨膜区和二级结构模拟.结果:重组体的转录受AFP顺式作用元件调控,Linker所在部位柔性高,可及性弱,不改变两侧蛋白分子的抗原性和疏水性.融合蛋白表达后,被CD80tm锚定于肝癌细胞表面,超抗原部分(SEA)表达在细胞膜外,二级结构预测Linker不改变蛋白结构,完全符合作者设计疫苗的初衷.结论:重组疫苗设计合理,特异性高,融合蛋白有很大可能保留了SEA和CD80tm的理化特性,为进一步的实践操作提供了可靠的理论基础.