黄海蓝点马鲛mtDNA D-loop序列变异分析

• 作者: 喻子牛 姜艳艳 孔晓瑜 庄志猛 金显仕
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 蓝点马鲛 mtDNA D-loop 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2003,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 177-183
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.479
• 字数: 3457字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2003.03.001

摘要

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对山东半岛南岸水域的蓝点马鲛(Scomberomorus niphonius)群体(n=20)的mtDNA D-loop序列进行扩增,获得了大小约为500 bp的扩增产物.PCR产物经纯化后进行序列测定,得到了410 bp的核苷酸片段(除去引物及部分端部序列).用Genedoc软件进行排序比较,在这20个个体中,共检测到54个变异位点,包括2个碱基缺失、1个碱基插入、43个转换位点、7个颠换位点及2个转换与颠换同时存在的位点.运用MEGA软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了UPGMA和NJ系统树.用DNASP软件计算出的多态位点数(S)为54、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.027 1和11.047.研究结果表明,蓝点马鲛的mtDNA D-loop基因个体变异程度较大,适合于群体内及群体间不同个体的遗传多样性分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	庄志猛		6	313	6.0	6.0
2	孔晓瑜	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	17	473	13.0	17.0
3	喻子牛	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	7	308	6.0	7.0
4	姜艳艳	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	2	33	2.0	2.0