西藏牦牛mtDNA D-loop区的遗传多样性及其遗传分化

• 作者: 信金伟 姬秋梅 张成福 徐利娟 钟金城
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 西藏牦牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 页码范围: 1387-1395
• 分类号: S823
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb201101230116

摘要

通过测定和分析西藏11个牦牛类群114个个体的mtDNA D-loop区全序列,对西藏牦牛的遗传多样性、类群间的亲缘关系及其遗传分化进行了研究.结果表明:①西藏牦牛mtDNA D-loop区全序列长度为890-896 bp,4种核苷酸T、C、A、G的平均比例分别为28.5％、25.3％、32.4％、13.8％,西藏牦牛mtDNA D-loop区富含碱基A+T,表现出一定的碱基偏好性.②共检测到130个变异位点,占分析总位点数的14.33％；其中单一多态位点85个,占多态位点总数的65.38％,简约信息位点45个,占多态位点总数的34.62％.序列变异中碱基缺失、插入和碱基替换等均有,其中碱基替换变异类型中转换114次,颠换12次,在转换变异类型中以A/G、T/C为主,占95.61％,在颠换变异类型中以A/T为主,占75％.③在114个个体中鉴定出90种单倍型,单倍型多样性为0.981±0.008,核苷酸多样性为0.01056±0.00701,均说明西藏牦牛具有丰富的单倍型类型.④90种单倍型分为2个聚类簇(Ⅰ、Ⅱ),聚类簇Ⅰ包含80种单倍型,占全部单倍型的88.89％,涵盖本研究中所有的西藏牦牛类群；聚类簇Ⅱ中有10种单倍型,占单倍型总数的11.11％,涉及的类群有工布江达、帕里、丁青、巴青、江达、类乌齐、桑桑、桑日、斯布,说明西藏牦牛可能有2个母系起源.⑤西藏牦牛类群间核苷酸分歧度(Dxy)在0.503％-1.416％之间,聚类分析和AMOVA分析显示西藏牦牛可分为两大类,康布牦牛、嘉黎牦牛为一类,其余的牦牛类群为另一类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姬秋梅	西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所	39	415	13.0	18.0
2	张成福	西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所	23	162	7.0	12.0
3	信金伟	西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所	21	145	7.0	11.0