人程序化死亡分子5(PDCD5)核酸和蛋白质序列的数据发掘

• 作者: 郑霙 马大龙
• 来源期刊: 北京大学学报医学版
• 关键词: 序列同源性 生物信息学 TFAR19 PDCD5
• 年，卷（期）: 2003,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 353-359
• 页数: 7页
• 分类号: R34
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-167X.2003.04.004

摘要

目的:以程序化死亡分子5(PDCD5)为靶分子,对其核酸与蛋白质序列进行生物信息学分析,为PDCD5功能的实验研究提供基础,同时也为人类功能基因的生物信息学分析提供新的技术路线.方法:利用数据库相似性搜索、同源物结构比较、表达谱分析和查询基因"邻居"等技术进行数据发掘和数据综合分析.结果:发现人PDCD5在12号和5号染色体上分别存在返座假基因(retropseudogene),小鼠1号染色体也存在小鼠PDCD5 cDNA的返座假基因.热自养甲烷杆菌的PDCD5同源物、泛素及核糖体蛋白S13具有与人PDCD5相似的折叠方式.线虫的PDCD5同源物、泛素及IAP(inhibitor of apoptosis proteins)分子等在表达谱拓扑图上属于同一基因簇成员,该基因簇与生物合成和蛋白质合成相关.PDCD5同源物在多个基因组中与多种核糖体蛋白相邻.结论:PDCD5存在2个拷贝的假基因.PDCD5除参与细胞凋亡外,预测还与泛素有功能相关性,并可能参与蛋白质的翻译调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马大龙	北京大学人类疾病基因研究中心	71	944	16.0	28.0
2	郑霙	北京大学人类疾病基因研究中心	1	9	1.0	1.0