蛋白质、核酸序列信息的获取、管理和发布

• 作者: 刘贝 尚彤 张丹 张其鹏 谭耀麟
• 来源期刊: 北京大学学报医学版
• 关键词: 数据库,文献型 生物医学工程 信息存贮和检索
• 年，卷（期）: 2002,（1）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 83-85
• 页数: 3页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-167X.2002.01.020

摘要

目的:建立通用的蛋白质、核酸序列信息数据类型和数据库结构,为建立专用的生物医学信息数据库奠定基础.设计自动获取数据的软件,彻底改变手动获取数据的方式.方法:以美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立的GenBank数据库和欧洲分子生物信息学实验室(EBI)维护的Swiss-Prot数据库分别作为一级和二级数据库的信息来源;通过分析,设计新的数据模型;建立本地数据库.编写了专用软件从网上获取数据,并且进行分类整理,存入数据库,同时利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索.结果:建立核酸、蛋白质常用信息数据库,设计相关信息获取、管理软件.以心衰相关基因数据库为例,利用所设计系统实现专业生物信息数据库.提出网上发布的方案.结论:结合生物技术研究的需要,设计软件获取网上的生物信息数据,可以大大地提高效率.将不同的数据库数据结合起来,建立新的数据类型和数据分类,可以改进查询方式,并实现本地发布.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尚彤	北京大学心血管基础研究所	15	144	7.0	12.0
2	张丹	北京大学心血管基础研究所	59	647	10.0	24.0
3	张其鹏	北京大学心血管基础研究所	16	73	5.0	8.0
4	刘贝	清华大学电子工程系	1	10	1.0	1.0
5	谭耀麟	清华大学电子工程系	1	10	1.0	1.0