序列拼装程序的并行化研究与实现

• 作者: 廖文昭 童维勤 蔡立志
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 并行化 序列拼装 消息传递
• 年，卷（期）: 2003,（14）
• 所属期刊栏目: 学术探讨
• 页码范围: 105-107
• 页数: 3页
• 分类号: TP311
• 字数: 3490字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-8331.2003.14.031

摘要

基因序列拼装是分子生物研究的重要环节之一.随着DNA序列的快速增长,如何提高基因序列拼装的速度,成为当前基因组研究的重要问题.为充分利用SMP以及集群的资源,在找出Phrap程序的瓶颈后,分别在SUN Enterprise3500及集群上将串行的Phra程序进行了并行化.论文论述实现并行拼接程序的机理和性能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童维勤	上海大学计算机学院	37	217	7.0	12.0
2	廖文昭	上海大学计算机学院	2	6	1.0	2.0
3	蔡立志	上海大学计算机学院	3	13	2.0	3.0