剪接比对软件sim4的并行化研究与实现

• 作者: 张雯 王金华 赵翔 靳新 骆志刚
• 来源期刊: 微电子学与计算机
• 关键词: 剪接比对 sim4 数据划分 并行化
• 年，卷（期）: 2006,（9）
• 页码范围: 91-93,95
• 页数: 4页
• 分类号: TP31
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7180.2006.09.031

摘要

随着人类基因组测序的完成,将序列比对到基因组序列之上成为研究序列功能结构的一种重要方法.sim4程序是目前比较流行的序列剪接比对工具之一.但在全基因组范围内进行比对时程序花费时间较长,文章讨论了不同的并行化方案并对sim4程序进行了优化及并行化,实验测试证明该方法可获得较好的运行性能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	骆志刚	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	29	362	7.0	18.0
2	赵翔	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	7	126	2.0	7.0
3	王金华	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	3	3	1.0	1.0
4	张雯	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
5	靳新	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	1	1	1.0	1.0