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mRNA可变剪接问题的并行化研究
mRNA可变剪接问题的并行化研究
作者:
牛北方
迟学斌
郎显宇
陆忠华
原文服务方:
计算机应用研究
可变剪接
AltSplice
并行化
表达序列标签(EST)序列库
消息传送接口
摘要:
对mRNA可变剪接问题进行了并行化分析和研究,解决了原AltSplice程序中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本MPI_AltSplice,并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能.
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调控
真核基因可变剪接研究现状与展望
可变剪接
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篇名
mRNA可变剪接问题的并行化研究
来源期刊
计算机应用研究
学科
关键词
可变剪接
AltSplice
并行化
表达序列标签(EST)序列库
消息传送接口
年,卷(期)
2008,(3)
所属期刊栏目
算法研究探讨
研究方向
页码范围
705-708
页数
4页
分类号
TP311.52
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-3695.2008.03.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陆忠华
7
40
4.0
6.0
2
迟学斌
10
83
6.0
9.0
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
全文
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2008(0)
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研究主题发展历程
节点文献
可变剪接
AltSplice
并行化
表达序列标签(EST)序列库
消息传送接口
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
计算机应用研究
主办单位:
四川省计算机研究院
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-3695
CN:
51-1196/TP
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1984-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
21004
总下载数(次)
0
总被引数(次)
238385
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
信息技术
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