豚鼠ESR2基因新的可变剪接体克隆及序列分析

• 作者: 司景磊 李龙 蒋钦杨 郭亚芬 郭晓萍 陈秋明
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 豚鼠 产仔性能 ESR2基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 731-735
• 页数: 5页
• 分类号: S865.1+1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.05.731

摘要

[目的]对豚鼠雌激素受体2(ESR2)基因进行克隆及序列分析,并预测分析其编码的蛋白序列,为提高豚鼠产仔性能及其育种打下基础.[方法]根据GenBank已公布的豚鼠ESR2基因序列(登录号XM003472337)设计引物,以豚鼠卵巢组织总RNA为模板,RT-PCR扩增ESR2基因编码区序列(CDS),利用生物信息学分析其编码蛋白氨基酸的组成及理化性质、二级结构及与相关物种的同源性.[结果]克隆获得的豚鼠ESR2基因CDS长度为1650bp,编码549个氨基酸,比参照序列(XM 003472337)少54个碱基,是ESR基因新的可变剪接体,且第7外显子缺失;蛋白质二级结构预测结果表明,豚鼠ESR2成熟肽包含α螺旋、β折叠和无规卷曲3种二级结构元件,由于缺失18个氨基酸导致蛋白质结构发生变异;同源性分析结果显示,豚鼠与长尾龙猫、奥氏更格卢鼠、马、达马拉鼹鼠、裸鼢鼠、鼠狐猴、八齿鼠、猪和人的ESR2基因序列同源性分别为91％、87％、86％、91％、92％、86％、88％、92％和86％.[结论]克隆获得的豚鼠ESR2基因为新的可变剪接体,可作为研究豚鼠产仔性能及豚鼠育种重要的候选基因之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋钦杨	广西大学动物科学技术学院	97	256	8.0	12.0
2	郭亚芬	广西大学动物科学技术学院	113	570	9.0	20.0
3	陈秋明	广西大学动物科学技术学院	6	8	2.0	2.0
4	司景磊	广西大学动物科学技术学院	14	4	1.0	2.0
5	李龙	广西大学动物科学技术学院	15	14	2.0	3.0
6	郭晓萍	广西大学动物科学技术学院	13	11	2.0	3.0