拉伸分子动力学模拟配体-受体相互作用

• 作者: 沈建华 沈旭 罗小民 蒋华良 许叶春 陈凯先
• 来源期刊: 中国科学B辑
• 学科: 化学
• 关键词: 分子动力学 拉伸分子动力学 配体和受体相互作用研究
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 评述
• 页码范围: 177-187
• 页数: 11页
• 分类号: O6
• 字数: 8495字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1006-9240.2004.03.001

摘要

配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理,为合理药物设计提供线索.新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时间范围内发生的生物化学过程可以在纳秒尺度内进行模拟,从而动态再现目前实验所无法提供的配体与受体的结合或解离过程.文中通过详细介绍拉伸分子动力学方法对石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶结合和解离过程以及HIV-1逆转录酶和其非核苷酸类似物抑制剂α-APA解离过程的成功模拟,综述拉伸分子动力学模拟在研究配体和受体相互作用中的应用.