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RGD与特定形貌金红石表面相互作用的分子动力学模拟
RGD与特定形貌金红石表面相互作用的分子动力学模拟
作者:
吴春亚
赫晓东
郑庭
郭闯强
陈妮
陈明君
原文服务方:
化工学报
金红石
表面拓扑结构
肽
分子模拟
水溶液
摘要:
精氨酸–甘氨酸–天冬氨酸(Arg-Gly-Asp,RGD)序列是细胞膜整合素受体与细胞外配体相结合的识别位点,利用其对材料表面进行仿生修饰可以提高植入体的生物相容性。采用全原子分子动力学方法,模拟研究了 RGD与理想和具有不同深度凹槽结构的金红石型 TiO2(110)表面的结合模式和结合稳定性。研究结果表明,在纯水环境下,RGD在金红石表面存在锚定点是该序列中带负电的羧基基团与表面 Ti原子直接键合的前提。凹槽侧壁表层的不饱和原子是 RGD 形成吸附的潜在作用点,故在金红石表面引入凹槽结构能在一定程度上影响该序列同基底之间的结合模式。当RGD通过羧基基团与槽底原子稳定键合之后,若剩余部分的长度足以触及至槽壁区域,则肽链中带正电的氨基或胍基基团与槽壁原子形成氢键的概率较大;若 RGD 通过两侧末端基团分别同槽底形成了稳定作用,则会显著抑制该序列与槽壁原子之间氢键的形成。RGD序列同金红石表面结合作用的强弱取决于结合点的数量以及相互作用的具体类型。
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文献信息
篇名
RGD与特定形貌金红石表面相互作用的分子动力学模拟
来源期刊
化工学报
学科
关键词
金红石
表面拓扑结构
肽
分子模拟
水溶液
年,卷(期)
2017,(1)
所属期刊栏目
表面与界面工程
研究方向
页码范围
199-207
页数
9页
分类号
TG146.2+3
字数
语种
中文
DOI
10.11949/j.issn.0438-1157.20160784
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈明君
哈尔滨工业大学机电工程学院
63
1371
22.0
35.0
2
郭闯强
哈尔滨工业大学机电工程学院
10
76
5.0
8.0
3
郑庭
哈尔滨工业大学机电工程学院
1
2
1.0
1.0
4
陈妮
哈尔滨工业大学机电工程学院
3
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2.0
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研究主题发展历程
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金红石
表面拓扑结构
肽
分子模拟
水溶液
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
化工学报
主办单位:
中国化工学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0438-1157
CN:
11-1946/TQ
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1923-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
12283
总下载数(次)
0
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