利用SAGE库挖掘有功能的假设基因

• 作者: Choi A M 宁文 李朝军 潘兴元
• 来源期刊: 扬州大学学报(农业与生命科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因表达的系列分析 低氧 生物信息学 假设基因
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 页码范围: 29-32
• 页数: 4页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 2220字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-4652.2004.03.009

摘要

利用生物信息学方法,从人大动脉内皮细胞(HAECs)低氧处理的基因表达的系列分析(SAGE)库中,挖掘出许多与低氧反应相关的假设基因.共预测到369个有功能的假设基因,其表达产物大部分与信号传导和基因的表达调控相关.选择了8个候选基因,RT-PCR验证其是否真正表达,其中7个为真基因.半定量RT-PCR表明,这些基因表达水平的变化在低氧处理的人脐静脉内皮细胞(HUVECs)中得到验证.结果表明:SAGE库中包含丰富的假设基因资源,可以用生物信息学方法从中鉴定与特定生理或病理过程相关的假设基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李朝军	南京师范大学分子医学生物学实验室	56	497	12.0	19.0
2	潘兴元	南京师范大学分子医学生物学实验室	1	3	1.0	1.0