人B组轮状病毒WH-1株NSP2基因片段的克隆与序列分析

• 作者: 叶临湘 唐少文 李燕 杨继红 王斌 郑华英
• 来源期刊: 中国人兽共患病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人B组轮状病毒 非结构蛋白NSP2 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 109-112
• 页数: 4页
• 分类号: R373.9
• 字数: 3133字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2004.02.009

摘要

目的了解人B组轮状病毒近20年来基因变异情况,为轮状病毒疫苗的研制提供依据.方法利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,扩增人B组轮状病毒WH-1株NSP2基因489bp的片断,并将其克隆到载体pUCmT,转化感受态细胞One-shot Top10F',提取转化菌质粒经限制性内切酶PstI酶切分析,筛选出阳性菌提取质粒,对插入片段进行了测序和核苷酸序列分析.结果利用GeneBee与其他B组轮状病毒株ADRV(人)、CAL-1(人)及IDIR(鼠)的NSP2基因进行同源性比较,发现毒株WH-1与ADRV核苷酸序列的同源性达99.8%,与CAL-1达93.7%,与IDIR(鼠)的同源性为80.0%.使用PredictProtein软件分析WH-1NSP2的蛋白组成,发现其编码的149个氨基酸组成的多肽中,含有1个潜在的N-糖基化位点和多个磷酰化位点.从氨基酸序列的同源性看,WH-1与ADRV的同源性达99.3%,与CAL-1达98.6%,而与IDIR为86.2%.结论 WH-1与ADRV的起源相同,且B组轮状病毒NSP2基因保守性很高.对人B组轮状病毒NSP2基因序列分析将有助于B组轮状病毒的流行病学、基因进化以及轮状病毒疫苗的研制都将有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶临湘	华中科技大学同济医学院流行病学教研室	58	614	13.0	22.0
2	唐少文	华中科技大学同济医学院流行病学教研室	6	19	3.0	4.0
3	王斌		36	141	7.0	9.0
4	杨继红		12	52	5.0	7.0
5	郑华英		20	131	7.0	11.0
6	李燕		6	37	4.0	6.0