人轮状病毒非结构蛋白NSP4基因特征的初步分析

• 作者: 侯宗柳 周丽芳 王明珠 赵亚玲 魏群德 黄永坤
• 来源期刊: 昆明医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 轮状病毒 非结构蛋白NSP4 基因特征 基因变异
• 年，卷（期）: 2004,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 47-50
• 页数: 4页
• 分类号: R373.2|R723
• 字数: 3099字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-4706.2004.04.012

摘要

目的:初步了解重症腹泻轮状病毒株NSP4基因特征及变异情况.方法:在2002年100例秋冬季腹泻患儿轮状病毒分子流行特征的研究中,确诊为轮状病毒腹泻的10例患儿的粪便标本,用PCR方法对其NSP4基因进行测定,并挑选出一株重症腹泻轮状病毒毒株(简称02'K1),采用一步法RT-PCR对其NSP4基因进行扩增获得NSP4 cDNA,利用银染测序方法对所扩增获得NSP4 cDNA进行测定.采用Winegene231核酸分析软件对02'K1株NSP4核苷酸序列进行翻译,同时利用Omiga生物软件对02'K1株、ST3株(人轮状病毒G4血清型)及代表NSP4四个主要基因型的之一的Wa株(简称Wa-1株)、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸序列进行比较,分析其同源性及02'K1株的NSP4氨基酸变异位点.结果:(1)经一步法RT-PCR扩增获得的NSP4 cDNA约725 bp,NSP4基因全长686个核苷酸,含有一个开放读码框架,编码一个由175个氨基酸组成的蛋白;(2)02'K1株与ST3株、Wa-1株、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸同源性均达90%以上;(3)与ST3比较,02'K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异,即aa16、aa26、aa60、aa72、aa76、aa124、aa135、aa140、aa141、aa 145、aa146、aa161、aa162、aa169.结论:(1)02'K1株的NSP4基因型属于Wa组;(2)02'K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄永坤	昆明医学院第一附属医院儿科	115	803	17.0	23.0
2	周丽芳	昆明医学院第一附属医院儿科	34	226	10.0	13.0
3	侯宗柳	中国医学科学院医学生物研究所	22	115	6.0	9.0
4	魏群德	昆明医学院第一附属医院儿科	13	84	4.0	9.0
5	赵亚玲	昆明医学院第一附属医院儿科	13	75	4.0	8.0
6	王明珠	昆明医学院第一附属医院儿科	2	4	2.0	2.0