高致病性PRRSV SC-JX01株Nsp2基因的序列分析和抗原表位预测

• 作者: 林华 郭万柱 郭宇飞 郭杨
• 来源期刊: 中国兽医杂志
• 关键词: 高致病性PRRSV Nsp2基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 10-13
• 分类号: S852.65+9.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0529-6005.2010.04.003

摘要

将扩增SC-JX01株得到的Nsp2基因cDNA片段克隆于pMD-T载体中.提取pMD-Nsp2质粒,测序后利用DNAStar软件进行序列分析.结果表明,SC-JX01株Nsp2基因与GenBank已发表的高致病性PRRSV Nsp2基因序列的相似性为98.1%~99.1%,氨基酸的相似性为95.9%~98.0%,具有相同的30个氨基酸缺失.本研究表明,SC-JX01株Nsp2基因与分离自不同地区高热病毒株的Nsp2基因序列具有相同的缺失.由于SC-JX01株的Nsp2基因存在氨基酸的缺失,与VR2332株比较,其亲水性、抗原指数均发生了大的变化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭万柱	四川农业大学动物生物技术中心	166	1465	21.0	28.0
2	郭杨	四川农业大学动物生物技术中心	5	161	4.0	5.0
6	林华	四川农业大学动物生物技术中心	15	36	4.0	5.0
7	郭宇飞		4	14	2.0	3.0