云南高致病性PRRSV Nsp2和ORF5基因变异分析

• 作者: 吕粤 岳亮 庞海洋 张富强 张应国 张文东 杨利琴 石凤海 赵焕云
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 Nsp2基因 ORF5基因 变异分析
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 页码范围: 15-22
• 分类号: S855.3
• 字数: 5444字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2010.11.004

摘要

为研究云南省高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)变异特征,采用RT-PCR对云南省2007年-2008年采集的56份猪组织样品中PRRSV Nsp2、ORF5基因进行检测,获得阳性样品12份,选择6份代表性样品将其PCR产物纯化后,克隆至pMD18-T载体后测序,并与已知代表毒株进行序列比对及系统发育分析.分离株Nsp2基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为94.9%～97.2%和91.4%～95.7%,其中1份样品(07YNMG)在486位～489位氨基酸发生了缺失.在系统进化树上可将其划分为4个亚组群,分离株分别与广东、贵州、浙江、山东等地分离毒株遗传关系密切.ORF5基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为97.8%～99.5%和97.0%～99.5%.氨基酸序列未发现缺失,仅个别位点发生点突变.系统进化树分析表明,分离株与浙江、贵州、广东、云南株亲缘关系较近,而与国内疫苗株以及PRRSV经典代表毒株CH-1a距离较远.