高致病性PRRSV TJ株和致弱毒TJM株Nsp2测序及结构分析

• 作者: 冷雪 刘准 李真光 武华 温永俊 王凤雪
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 非编码区 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医学
• 页码范围: 86-90
• 分类号: S852.65
• 字数: 3287字
• 语种: 中文

摘要

参照GenBank中PRRSV VR-2332株全序列设计特异性引物,扩增高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)TJ株和其致弱毒株TJM株非结构蛋白2(Nonstructure protein 2,Nsp2)编码区,经过基因的扩增、连接、转化、筛选阳性克隆进行核苷酸测序.结果表明,PRRSV TJ株Nsp2长2 850 bp,TJM株Nsp2长2 490 bp.通过序列比较分析,发现Nsp2编码区序列保守性差,TJ株和TJM株Nsp2与VR-2332核苷酸序列的同源性分别为83.6%和82.9%,运用RNAdraw软件对Nsp2编码区RNA的2级结构预测分析表明,分离的高致病性强毒株TJ株和细胞致弱毒株TJM株与经典毒株VR-2332有较大不同,PRRSV Nsp2的1级序列的变化导致RNA的2级结构发生构象变化,推测这可能是3个PRRSV毒株致病力不同的原因之一.