侵染东方百合的黄瓜花叶病毒两个分离物cp基因克隆和进化分析

• 作者: 刘文洪 叶美琴 洪健 陈集双
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜花叶病毒 东方百合 分子鉴定 寄主适应性
• 年，卷（期）: 2004,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 442-445
• 页数: 4页
• 分类号: S6
• 字数: 2816字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2004.04.018

摘要

从浙江丽水和杭州的东方百合(Lilium cv.Oriental hybrids)上得到2个黄瓜花叶病毒分离物CMV-LS和CMV-HZ,采用RT-PCR法分别扩增得到2条长约1000 nt片段,经序列测定,全长分别为996 nt和998 nt,两分离物的外壳蛋白(cp)基因由657 nt组成.将两分离物的cp基因与其它24个CMV分离物进行了同源性比较,在cp基因核苷酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.6%～99.7%和68.6%～77%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.7%～98.8%和68.6%～77%.在氨基酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.5%～99.1%和65.7%～78.5%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.1%～98.6%和66.4%～78.1%.表明两分离物均属于CMV亚组Ⅰ成员.cp基因序列系统进化树分析表明,来自百合的CMV分离物在系统进化树中单独成簇,不受地域差异的影响,出现了寄主适应性变异,形成明显的株系分化趋势.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	洪健	浙江大学分析测试中心	75	1279	19.0	31.0
2	陈集双	浙江大学生命科学学院	44	684	13.0	24.0
3	叶美琴		8	92	6.0	8.0
4	刘文洪	浙江大学生命科学学院	5	90	4.0	5.0