北京新发现的人偏肺病毒N蛋白编码基因的序列分析

• 作者: 朱汝南 钱渊
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 人偏肺病毒 N蛋白基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 81-84
• 页数: 4页
• 分类号: S373
• 字数: 3216字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2004.02.001

摘要

目的了解新近从北京地区发现的人类偏肺病毒(human metapneumovirus, HMPV)N蛋白编码基因的特征. 方法从经RT-PCR检测HMPV阳性的临床鼻咽洗液标本中进行HMPV N蛋白全基因扩增、克隆至pUCm-T载体中并进行测序,与GenBank中的多株HMPV N蛋白基因序列进行比较和进化树分析. 结果经扩增并测序,标本BJ1816和BJ1887 N蛋白基因全长为1185bp,编码394个氨基酸.BJ1816 N蛋白基因与国际上第一株HMPV分离株NDL00-1和GenBank中其它的多株HMPV的核苷酸和氨基酸同源性分别为86.2%～99.0%和96.2%～99.7%.BJ1887 N蛋白基因与以上进行比较的各株HMPV的核苷酸和氨基酸同源性分别为86.6%～97.0%和96.4%～99.5%.BJ1816和BJ1887之间N基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为86.6%和96.4%.提示BJ1816和BJ1887分属于HMPV的两个不同的基因进化簇. 结论从基因水平进一步证明新近发现的婴幼儿肺炎的新病原确为HMPV,提示北京地区婴幼儿中同时存在两个不同进化簇(即基因型)的HMPV感染.