人膀胱癌相关蛋白基因及其编码蛋白质的结构及功能预测

• 作者: 伍欣星 刘娟 熊金虎
• 来源期刊: 武汉大学学报(医学版)
• 学科: 医学
• 关键词: 人膀胱癌相关蛋白基因 生物信息学 蛋白质结构 蛋白质功能 预测宫颈癌
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 217-219,223
• 页数: 4页
• 分类号: R739.41
• 字数: 2697字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8852.2004.03.002

摘要

目的:预测人宫颈癌候选抑癌基因--膀胱癌相关蛋白(BLCAP)基因及其编码蛋白质的结构及功能.方法:将克隆有全长BLCAP基因的pLXSN-BLCAP质粒测序后,采用生物信息学的方法对其在核酸及氨基酸水平上进行分析,并对其编码的蛋白质的功能做了初步预测.结果:发现了几条与BLCAP基因同源性较高的基因:Homo sapiens mRNA(DKFZp564M053),BC-10基因等,它们与BLCAP基因的序列相似性分别为:99%和87%,而且不同种属间BLCAP基因较为保守.BLCAP基因编码的87个氨基酸中亮氨酸(19.5%)、脯氨酸(9.19%)、丝氨酸(8.04%)、半胱氨酸(8.04%)含量较高,对其二级结构的分析发现BLCAP基因编码蛋白N端以螺旋结构为主,C端以折叠结构为主,亲水性较高,而中间区域则以无规则卷曲为主,疏水性较高.在其45aa～65aa处存在一个跨膜区,在59aa～66aa处可能存在一个裂解位点,在68位的Tyr,73位和78位的Ser存在着3个可能的磷酸化位点,且在78aa～81aa处发现一个典型的[ST]-X(2)-[DE]结构,即酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点.结论:初步预测BLCAP基因为一个调节细胞生长的看家基因,其编码的蛋白质为一个Ⅰ型跨膜蛋白,且其酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点可能与BLCAP蛋白功能活化有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	伍欣星	武汉大学医学院病毒学研究所分子病毒学研究室	51	117	6.0	7.0
2	熊金虎	武汉大学中南医院检验科	13	57	5.0	6.0
3	刘娟	武汉大学医学院病毒学研究所分子病毒学研究室	90	502	13.0	18.0