大规模RNA阵列验证水稻茎组织特异性高表达基因

• 作者: 于凤池 徐绍忠 李德葆 王晟 董海涛 谭学林
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 阵列 水稻 茎 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2004,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 357-362
• 页数: 6页
• 字数: 5136字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2004.04.002

摘要

在前期大规模水稻(Oryza sativa)ST测序和生物信息学分析的工作中,发现一些在茎cDNA文库中高水平表达基因,包括叶绿素a/b结合蛋白(T007D10)、富脯氨酸蛋白(S037D04)、脱落酸和逆境诱导蛋白(S057B03)、微管蛋白(S060D11)等基因.为验证这些基因是否为茎特异性表达基因,选择高冗余度的EST克隆制备cDNA探针,与高通量的RNA阵列进行杂交.结果表明:叶绿素a/b结合蛋白基因在叶中高丰度表达且受光诱导,是一个光合作用相关基因,而不是茎特异性基因;微管蛋白基因在茎和根中都具有较高的表达丰度,说明根的纤维化和茎的木质化是同一生化过程;脱落酸和逆境诱导蛋白基因虽然在茎中高表达,但其丰度容易受环境条件(如营养缺乏、逆境等)的影响,而不是在茎中以组成型方式稳定表达,不能被称为茎特异性表达基因.这些结果提示出在一个EST数据库中高冗余度的基因并不能完全代表该文库的特征,也不能单纯通过EST分析技术认定它们是组织特异性表达基因,需要进一步的确认.通过在不同发育阶段、不同生理状态及不同逆境状态下获得全局性的表达谱特征,才能较客观地评价一个基因是否为组织特异性表达基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭学林	云南农业大学稻作研究所	140	1356	19.0	30.0
2	李德葆	浙江大学农业与生物技术学院	76	2052	28.0	43.0
3	董海涛	浙江大学农业与生物技术学院	30	637	12.0	25.0
4	徐绍忠	云南农业大学稻作研究所	36	169	7.0	12.0
5	王晟	浙江大学农业与生物技术学院	7	27	4.0	5.0
6	于凤池	浙江大学农业与生物技术学院	3	62	3.0	3.0