与家蚕细胞凋亡相关的Caspase基因BmIce的克隆和序列分析

• 作者: 夏庆友 朱虹 查幸福 段军 赵萍
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 细胞凋亡 Caspase 白细胞介素-1β转换酶 家蚕
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 261-267
• 页数: 7页
• 分类号: Q785|Q255|S881.2
• 字数: 3735字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2005.03.006

摘要

DrIce基因在果蝇的细胞调亡代谢途径中起着重要作用.采用tblastn程序将DrICE在家蚕EST数据库中进行同源性检索,检索到的EST序列进行电子延伸,根据延伸结果设计引物,用RT-PCR检测和克隆测序验证,成功地克隆到家蚕第二种Caspase基因的全长cDNA (GenBank登录号为:AY885228).克隆的cDNA长1 410 bp,ORF长825 bp,编码275个氨基酸残基,预测分子量为31.8 kD,等电点为6.15,基因名定为BmIce.将BmIce的cDNA与家蚕基因组序列进行比对,结果表明该基因具有6个外显子,外显子/内含子边界处均符合GT-AG规则.BmICE在氨基酸水平上与果蝇DrICE、线虫的CED-3的一致性分别为34%和29%,在第169个氨基酸残基处具有QACRG的五肽活性位点,该活性位点是Caspase家族的典型结构.与果蝇Caspase家族聚类分析中,BmICE与果蝇中具有短的N端结构域的DrICE、DCP-1及DECAY聚为一类,根据其结构分析和聚类分析,推测家蚕BmIce基因可能参与细胞凋亡的执行作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏庆友	西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室	32	590	15.0	23.0
2	赵萍	西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室	9	130	8.0	9.0
3	查幸福	西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室	5	97	5.0	5.0
4	段军	西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室	1	26	1.0	1.0
5	朱虹	西南农业大学蚕学与生物技术学院农业部蚕桑学重点开放实验室	1	26	1.0	1.0