小鹅瘟病毒GPV-YG株主要开放性阅读框架核苷酸序列分析

• 作者: 尤永进 徐泉兴 葛艳 陈谊 饶忠
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小鹅瘟病毒 开放性阅读框架 核苷酸序列
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 页码范围: 11-15
• 页数: 5页
• 分类号: S835|S852.65
• 字数: 3328字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3924.2005.02.003

摘要

通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Goose parvovirus,GPV)扬州分离株GPV-YG的2个主要开放性阅读框架(open reading frame,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录.将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主要ORF核苷酸序列与GPV-B的同源性为94%,显示二者亲缘关系密切.在此基础上,分别确定了GPV-YG编码结构蛋白和非结构蛋白的基因组序列,并推导出GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的相应的氨基酸序列,GPV-YG与GPV-B结构蛋白的氨基酸序列同源性为96.4%,非结构蛋白同源性为97.9%,由此进一步分析了GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的氨基酸序列与功能特征.同时,将GPV-YG主要ORF与番鸭细小病毒(Muscovy Duck Parvovirus,MDPV)-FM作比较,核苷酸序列同源性为80%,非结构蛋白推导氨基酸序列同源性为89.6%,结构蛋白为84.6%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尤永进	上海市农业科学院畜牧兽医研究所	8	93	5.0	8.0
2	葛艳	上海市农业科学院畜牧兽医研究所	4	46	3.0	4.0
3	饶忠	上海市农业科学院畜牧兽医研究所	9	66	4.0	8.0
4	徐泉兴	上海市农业科学院畜牧兽医研究所	10	87	4.0	9.0
5	陈谊	上海市农业科学院畜牧兽医研究所	16	416	8.0	16.0