暗纹东方鲀线粒体细胞色素b及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析

• 作者: 史全良 朱江 邵爱华 陈葵
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 暗纹东方鲀 线粒体DNA 细胞色素b 系统学
• 年，卷（期）: 2005,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 675-681
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.468
• 字数: 4380字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2005.06.002

摘要

以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方豚(Takifugu rubripes)线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定线粒体细胞色素b(Cyt b)及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆的暗纹东方鲀Cyt b基因(1 137 bp)及其5′端上游的tRNAGlu基因和3′端下游的tRNAThr基因序列共1 327bp.用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中10个目13种鱼类的Cyt b序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的Cyt b基因具有较高的同源性,与同属红鳍东方鲀的同源性最高,为96.1%;与同目不同科的矛尾翻车鲀(Masturuslanceolatus)和翻车鲀(Mola mola)的同源性分别为74.1%和74.8%.tRNAGlu因由69个碱基组成,tRNAThr基因由72个碱基组成,与红鳍东方鲀相应tRNA的碱基组成完全相同.推定的这两种tRNA的二级结构都具有典型的三叶草型结构,各臂的碱基配对率高,稳定性好.根据暗纹东方鲀与其他13种鱼的Cyt b基因序列同源性所建立的进化树比较,结果与传统的分类地位基本吻合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵爱华	苏州大学生命科学学院	14	157	8.0	12.0
5	陈葵	苏州大学生命科学学院	34	273	10.0	16.0
6	朱江	苏州大学生命科学学院	114	733	13.0	22.0
7	史全良	苏州大学生命科学学院	25	292	11.0	16.0