红鳍东方鲀组织蛋白酶L基因的电子克隆及序列分析

• 作者: 梁静真 邓富琳 陈蓉 饶颖竹
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 红鳍东方鲀 组织蛋白酶L 生物信息学 电子克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 1569-1574
• 页数: 6页
• 分类号: Q959.489
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2012.10.1569

摘要

[目的]采用电子克隆技术克隆红鳍东方鲀组织蛋白酶L基因,并应用生物信息学技术分析其推导氨基酸的序列特征,为进一步探索其在免疫功能中的作用奠定基础.[方法]以斑马鱼的组织蛋白酶L核苷酸序列(Y08321.1)为探针,对红鳍东方鲀基因组数据库进行BLASTn分析,将检索到的匹配结果进行碱基3′端及5′端的适当延长,用DNAssist预测其编码信息;然后从GenBank获取若干物种组织蛋白酶L序列,用DNASTAR软件进行比对.[结果]红鳍东方鲀组织蛋白酶L基因全长2005 bp,含7个外显子和6个内含子;包含编码336个氨基酸的开放阅读框(1011 bp);其推导的氨基酸序列具有组织蛋白酶L所特有的氨基酸保守结构域(ERWNIN和GNFD)及由Cys25、His159和Ash175残基组成的保守活性位点,与青鳉、鲤鱼的组织蛋白酶L基因具有较高的序列一致性.[结论]红鳍东方鲀组织蛋白酶L的一些结构域和催化活性位点在进化过程中比较保守,与鱼类物种来源的组织蛋白酶L在氨基酸水平上一致性较高,在进化上亲缘关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓富琳	湛江师范学院生命科学与技术学院/湛江师范学院经济动物资源利用与保护研究所	1	2	1.0	1.0