三角帆蚌组织蛋白酶L基因的克隆和序列特征与进化分析

• 作者: 李家乐 汪桂玲 白志毅
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 三角帆蚌 组织蛋白酶L 基因克隆 进化分析
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 104-111
• 分类号: S917.4
• 字数: 5560字
• 语种: 中文

摘要

组织蛋白酶L在多种生理过程中具有重要作用.根据本实验室构建的三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE方法克隆了三角帆蚌组织蛋白酶L基因的cDNA全序列(GenBank登录号为HQ610996).结果表明,该序列全长为1 105 bp,包括24 bp的5'-末端非转录区,1 002 bp的开放阅读框和79 bp的3'-末端非转录区,共编码333个氨基酸,包含1个由20个氨基酸组成的信号肽.推测的三角帆蚌组织蛋白酶L前体肽具有组织蛋白酶前体抑制因子功能结构域,具有组织蛋白酶L家族高度保守结构基序ERFNIN[E-X3-R-X2-(I/V)-F-X3-N-X3-I-X3-N]、GNFD和GCXGG;该蛋白的半胱氨酸类蛋白酶半胱氨酸、组氨酸和天冬氨酸活性位点均高度保守.同源性分析表明,推测的三角帆蚌组织蛋白酶L氨基酸序列与其他贝类高度保守,同源性在60%-74%之间.进化分析显示,三角帆蚌组织蛋白酶L与其他贝类组织蛋白酶L聚为一支,在该支中,三角帆蚌与软体动物淡水螺(R.peregra)的亲缘关系最近.本研究结果为进一步研究三角帆蚌组织蛋白酶L的生理功能提供基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白志毅	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	36	253	9.0	14.0
2	汪桂玲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	33	196	9.0	12.0