人偏肺病毒黏附蛋白的二级结构及B细胞表位初步预测

• 作者: 杨锡强 毛华伟 赵晓东
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人偏肺病毒 G蛋白 二级结构 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2005,（12）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 1031-1034
• 页数: 4页
• 分类号: R3
• 字数: 2779字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2005.12.021

摘要

目的预测人偏肺病毒G蛋白的二级结构及B细胞表位.方法分别采用SOPMA方法及HMMTOP程序预测G蛋白的二级结构和跨膜区域;综合分析蛋白的柔性结构、亲水性、表面可及性与抗原性指数,预测G蛋白的抗原表位.结果G蛋白的二级结构主要为柔性区域,占62.1%;α-螺旋占22.37%;β-折叠占15.53%;N端第32～51位氨基酸残基为跨膜区.B细胞表位位于G蛋白N端55～77、80～104、111～126、130～167、178～210区段.结论应用多参数预测G蛋白的二级结构与B细胞表位,为进一步研究蛋白特征、单克隆抗体制备及表位疫苗研制奠定了基础.