虎纹捕鸟蛛毒素-Ⅵ(HWTX-Ⅵ)和敬钊缨毛蛛毒素-Ⅷ(JZTX-Ⅷ)是两种蜘蛛多肽类神经毒素.它们的大部分氨基酸序列已由Edman降解法测出,但仍有部分序列由于某些原因未能确定.为了鉴定未知部分的序列,利用电喷雾电离-四极杆-飞行时间质谱(ESI-Qq-TOF-MS)对两种蜘蛛毒素的酶解产物进行分析,获得其酶解片段的一级(MS)和二级(MS/MS)图谱,在用软件和手工的方式对含有未知序列的肽段进行解析后,得到未知部分确切氨基酸序列.研究表明:利用质谱的从头测序(de novo sequencing)方法获得HWTX-Ⅵ和JZTX-Ⅷ完整的氨基酸序列.该方法在蛋白质和多肽的结构分析和鉴定与传统方法相比具有高灵敏度和快速的优势,是对传统Edman化学降解法的一个很好的补充.