H5N1亚型禽流感病毒A/duck/Shandong/093/2004株的全基因克隆及序列分析

• 作者: 刘玉良 刘秀梵 卢建红 王曲直 龙进学
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: H5N1亚型禽流感病毒 通用引物 全基因组序列 序列分析
• 年，卷（期）: 2005,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传学和分子生物学
• 页码范围: 690-696
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 5983字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2005.05.007

摘要

应用流感病毒通用引物[4]和H5N1亚型禽流感(Avian influenza virus,AIV)的型特异性引物,成功的扩增出H5N1亚型禽流感病毒A/duck/Shandong/093/2004株(简称A/D/SD/04)的全基因序列(包括5′和3′端的非编码区序列).A/D/SD/04的基因组核苷酸全序列与18株网上公布的禽流感基因序列进行比较和分析,结果与4株鸭源H5N1的5～7个基因具99%以上的同源性;与14株H5N1有至少一个以上内部基因同源性在95%以上.与H9亚型AIV代表株A/Quail/Hongkong/G1/97(简称G1株)和A/Chicken/Beijing/1/94(简称BJ94)比较,除了非结构基因(Nonstructural gene,NS)与G1株的同源性为95.3%外,其余基因均在36.6%～92.1%之间.说明A/D/SD/04没有H9N2基因的直接整合,是H5N1毒株在自然界的重组株.推导的HA氨基酸序列分析,A/D/SD/04 的血凝素(Heamgglutinin,HA)裂解位点与比较的16株AIV的序列一致,是高致病性禽流感的分子特征(PQRERRRKKR/G),第226位氨基酸是对禽类和哺乳细胞均具有亲嗜性的蛋氨酸(Met).神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)在第48位氨基酸(颈部)后有20个氨基酸的缺失,但非结构蛋白(NS)没有在79～84氨基酸发生缺失.碱性聚合酶2(PB2)的627位氨基酸是亲禽类细胞的谷氨酸(Glu,E).结合生物学特性和分子特征,A/D/SD/04对小鼠的致病力是由多种因素决定,其可能是一株对鸡高度致病,并逐渐获得对哺乳动物致病能力的中间重组病毒.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘秀梵	扬州大学畜牧兽医学院农业部畜禽传染病学重点开放实验室	373	3732	28.0	39.0
2	卢建红	扬州大学畜牧兽医学院农业部畜禽传染病学重点开放实验室	23	330	12.0	18.0
3	龙进学	扬州大学畜牧兽医学院农业部畜禽传染病学重点开放实验室	11	173	9.0	11.0
4	刘玉良	扬州大学畜牧兽医学院农业部畜禽传染病学重点开放实验室	20	180	10.0	13.0
5	王曲直	扬州大学畜牧兽医学院农业部畜禽传染病学重点开放实验室	5	79	4.0	5.0