植物萜类合成酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶的生物信息学分析

• 作者: 李嵘 王喆之
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物萜类合成 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR) 生物信息学
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 464-473
• 页数: 10页
• 分类号: Q942.6|Q943.2
• 字数: 5110字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3142.2006.05.002

摘要

采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的橡胶、烟草、辣椒、穿心莲等植物的萜类合成酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶的核酸及氨基酸序列进行分析,并对其组成成分、信号肽、跨膜拓朴结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行预测和推断.结果表明:该类酶基因的全长包括5'、3'非翻译区和一个开放阅读框,无信号肽,是一个跨膜的亲水性蛋白,包括两个功能HMG-CoA结合motif及两个功能NADPH结合motif,α-螺旋和不规则盘绕是蛋白质二级结构最大量的结构元件,β-转角和延伸链散布于整个蛋白质中,蛋白质的功能域在空间布局上折叠成"V"形,"V"形的两臂由螺旋状的N结构域和S结构域构成,中间部分由L结构域构成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王喆之	陕西师范大学生命科学学院	155	1966	25.0	35.0
2	李嵘	陕西师范大学生命科学学院	6	168	5.0	6.0