牙鲆Ⅰ型甲腺原氨酸脱碘酶基因片段的克隆及序列分析

• 作者: 刘华 施志仪
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 Ⅰ型甲腺原氨酸脱碘酶 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 111-117
• 页数: 7页
• 分类号: S9
• 字数: 5022字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-5464.2006.06.026

摘要

在GenBank中查找到已知的斑马鱼、奥尼罗非鱼、金头鲷、爪蟾等物种的Ⅰ型甲腺原氨酸脱碘酶的基因序列并运用Primer Premier 5.0软件对这些物种的Ⅰ型甲腺原氨酸脱碘酶基因序列进行同源性分析.依据同源性较大的保守区基因序列设计一对引物,并提取变态期牙鲆仔鱼总RNA作为模板进行RT-PCR,得到一条cDNA片段.将产物连接到T载体中,转化、扩增重组质粒.提取大肠杆菌中的重组质粒进行DNA测序.将DNA测序所得到的基因序列翻译成蛋白序列和已知的奥尼罗非鱼、金头鲷、底鳉、斑马鱼的Ⅰ型甲腺原氨酸脱碘酶基因序列进行同源性分析.结果显示,利用RT-PCR的方法扩增出一条280bp的目的基因片段,比对结果发现其和奥尼罗非鱼、金头鲷、底鳉、斑马鱼的Ⅰ型甲腺原氨酸脱碘酶基因的蛋白序列的同源性分别为85%,83%,81%,71%.对蛋白序列进行生物信息学分析发现整个蛋白序列中无信号肽,无糖基化位点,无跨膜结构域,但含有一个典型的T4_deiodinase结构.在N-端第69～70区段有β-折叠中心;第35～37区段可能形成转角或无规则卷曲;第8～13区段,第16～20区段等区段是柔性区域.D1蛋白N端第8～11区段,第47～55区段,第90～91区段为优势抗原表位区域.本实验所获得的基因序列是前尚未见报道的牙鲆Ⅰ型甲腺原氨酸脱碘酶基因序列的一部分,为进一步研究该基因的结构与生物学功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施志仪	上海水产大学生物技术研究中心	22	419	12.0	20.0
2	刘华	上海水产大学生物技术研究中心	2	10	1.0	2.0