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摘要:
根据GenBank上发表的口蹄疫(foot-and-mouth disease,FMD)全基因序列数据,设计了多对引物,采用RT-PCR的方法,分别对R株编码区和非编码区基因进行扩增,将各片段克隆至pMD18-T载体,进行核苷酸序列测定. 按顺序拼接各基因的序列,将结果序列与GenBank上各FMDV毒株的序列进行比较和同源性分析. 序列的比较和分析表明,R株编码区全长为6 966个核苷酸,共编码2 322个氨基酸;非编码区5′端内部核糖体结合位点(internal ribosome entry site,IRES)长约450个核苷酸,3′非翻译区(untranslatable region,UTR)从TAA始至Poly(A)前长度为94个核苷酸,所测出Poly(A)尾长度为18个核苷酸. 与GenBank世界流行毒株的序列比较,编码区核苷酸序列同源性为88%~90%,推导氨基酸序列同源性为88%~95%.
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文献信息
篇名 口蹄疫病毒R株基因组序列分析研究
来源期刊 华南农业大学学报 学科 农学
关键词 口蹄疫病毒 基因组 序列分析
年,卷(期) 2006,(2) 所属期刊栏目 研究简报
研究方向 页码范围 118-120
页数 3页 分类号 S852.659.6
字数 2240字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-411X.2006.02.030
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 罗满林 华南农业大学兽医学院 111 453 11.0 14.0
2 孙彦伟 48 272 9.0 13.0
3 林绍荣 华南农业大学兽医学院 23 184 4.0 13.0
4 余业东 10 39 4.0 5.0
5 贺东生 华南农业大学兽医学院 107 523 11.0 18.0
6 林小敏 华南农业大学兽医学院 4 23 2.0 4.0
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研究主题发展历程
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口蹄疫病毒
基因组
序列分析
研究起点
研究来源
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相关学者/机构
期刊影响力
华南农业大学学报
双月刊
1001-411X
44-1110/S
大16开
广州五山华南农业大学学报编辑部
1959
chi
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