A型口蹄疫病毒A/HeN/1/2009株全基因组序列的测定及其基因特征分析

• 作者: 刘强 朱琳 牟一娇 谢毅 赵兴绪
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 A/HeN/1/2009株 全基因组 东南亚拓扑型
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学·饲料科学
• 页码范围: 640-641,700
• 页数: 3页
• 分类号: S852.65+3
• 字数: 2184字
• 语种: 中文

摘要

[目的]测定A型口蹄疫病毒A/HeN/1/2009株全基因组序列并分析其基因特征,为研究我国最近发生的A型口蹄疫病毒的致病性、流行规律以及筛选适用的疫情防控疫苗株奠定分子基础.[方法]应用RT-PCR方法,分段扩增、克隆A/HeN/1/2009株基因,并进行基因测序；借助DNAStar分子生物学软件,从分子流行病学角度分析A/HeN/1/2009株与参考毒株之间可能的遗传衍化关系.[结果]该毒株基因组全长8 171 nts[不包括poly(C)区段和poly(A)尾巴],其中5'-UTR和3'-UTR分别为1 080、92nts,蛋白编码区为6 999 nts.分析A/HeN/1/2009株遗传衍化关系显示,该毒株划为东南亚拓扑型Laos03系的VN09亚系,同源性依次为87.3％ ～ 91.8％、93.7％ ～94.5％和96.9％～98.4％.[结论]VP1中A24V、N85R、S196T,3A中I61V、T128S、E147G和A134V在该毒群的进化过程中扮演重要角色；A/SH/1/2009株VP1 140-160基序为RSD.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘强	甘肃农业大学动物医学院	43	99	6.0	8.0
2	朱琳	甘肃农业大学动物医学院	2	4	1.0	2.0
3	牟一娇	甘肃农业大学动物医学院	2	6	2.0	2.0
4	谢毅	甘肃农业大学动物医学院	1	3	1.0	1.0
5	赵兴绪		1	3	1.0	1.0