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6株水产动物源气单胞菌安徽分离株的毒力基因的克隆与序列分析
6株水产动物源气单胞菌安徽分离株的毒力基因的克隆与序列分析
作者:
余为一
方兵
李槿年
汪天杰
祖国掌
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
气单胞菌
安徽分离株
毒力基因
序列分析
摘要:
根据气单胞菌主要黏附素基因(ahal)、溶血素基因(hly)和细胞兴奋性肠毒素基因(alt)完整开放阅读框(ORF)设计3对特异性引物,对6株气单胞菌安徽分离株进行ahal、hly和alt基因的PCR扩增、克隆和测序.测序结果显示,安徽分离株ahal、hly和alt基因的ORF大小分别为1 056~1 068 bp、1 482 bp和1 104~1 107 bp,各编码351~355、493和367~368个氨基酸.序列分析显示:(1)属于alt+ahal+hly+毒力基因型的3个安徽分离株间aha1核苷酸序列和推测的氨基酸序列同源性均很高,分别为98.8%~99.3%和97%~97.6%,且与国内参考株Ah/Trionyx sinensis/Guangzhou(Guangdong)/ AF276639的同源性高达98.5%~99%和96.8%~97.6%.而alt+ahal+hly-HA6安徽分离株与国外参考株Ah/Fish/ Barcelona(Spain)/AF183931间的核苷酸序列和氨基酸序列同源性较高,分别为95.8%和97.2%.(2)不同表型种气单胞菌安徽分离株之间及其与国内外其他分离株之间的hly核苷酸序列和推测的氨基酸序列同源性均较高,分别介于88.4%~100%之间和90.8%~98.7%之间.(3)5个安徽分离株(BA16、CA1、HA6、HA7和GA1)之间及其与惟一参考株之间的alt核苷酸序列和推测的氨基酸序列同源性分别高达93.5%~99.9%和80.2%~98.3%,但与BA17分离株间的核苷酸序列同源性(81.6%~81.7%)和推测的氨基酸序列同源性(77.5%~84.9%)均较低.这些结果表明,气单胞菌aha1和alt基因在不同毒力基因型间存在一定差异性,hly基因在不同表型种间存在较高保守性,该基因可作为研制气单胞菌基因工程亚单位疫苗的候选成分.
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文献信息
篇名
6株水产动物源气单胞菌安徽分离株的毒力基因的克隆与序列分析
来源期刊
中国水产科学
学科
农学
关键词
气单胞菌
安徽分离株
毒力基因
序列分析
年,卷(期)
2006,(6)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
966-972
页数
7页
分类号
S94
字数
3865字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:1005-8737.2006.06.015
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
余为一
安徽农业大学动物科技学院
121
1025
17.0
25.0
2
祖国掌
安徽农业大学动物科技学院
43
310
11.0
15.0
3
李槿年
安徽农业大学动物科技学院
98
829
15.0
23.0
4
方兵
安徽农业大学动物科技学院
4
80
4.0
4.0
5
汪天杰
安徽农业大学动物科技学院
2
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传播情况
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引文网络
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节点文献
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气单胞菌
安徽分离株
毒力基因
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国水产科学
主办单位:
中国水产科学研究院
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1005-8737
CN:
11-3446/S
开本:
大16开
出版地:
北京市永定路南青塔村150号
邮发代号:
18-250
创刊时间:
1994
语种:
chi
出版文献量(篇)
3187
总下载数(次)
1
总被引数(次)
54530
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