兔病毒性出血症病毒中国株(JX/CHA/97)全基因组分子克隆及序列分析

• 作者: 云涛 倪征 刘光清 张玉颖 方维焕 陈锦清
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 兔病毒性出血症病毒 JX/CHA/97株 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 668-671,675
• 页数: 5页
• 分类号: Q785
• 字数: 3490字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2006.06.014

摘要

本研究首次完成了兔病毒性出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)中国分离株JX/CHA/97全基因组序列的测定与分析.研究结果表明,JX/CHA/97株的全基因组由7 437个核苷酸组成,其基因组构成为:5'端有一个长度仅为9 nt的非编码区,随后有2个阅读框架(ORFs),分别编码一个聚合蛋白和一个结构蛋白.在基因组的3'端也有一个非编码区,长度为59 nt.另外,采用RACE方法获得了RHDV的poly(A)尾序,证明该结构至少含有27个A.根据RHDV衣壳蛋白的基因序列,将JX/CHA/株与来自世界各地的22株RHDV分离株的基因组序列进行了比较与分析,并绘制了系统发生树.结果表明,RHDV各分离株之间存在较高的序列同源性,可以将它们至少分为6个拓朴群,提示RHDV有朝不同方向发生进化的趋势.