VEGF siRNA的筛选、评价及siRNA的设计规则探讨

• 作者: 张洹 荆春霞
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: siRNA 血管内皮生长因子 设计 评价
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 579-585
• 页数: 7页
• 分类号: R73
• 字数: 3547字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6325.2006.06.005

摘要

目的设计并评价9条VEGF siRNA的干扰效果,并提出新的高效siRNA设计规则.方法用siRNA现有设计规则与计算机辅助结合共设计9条VEGF siRNA序列,长度为19 bp.体外转录法构建9条VEGF siRNA,通过脂质体介导转染神经胶质瘤U251细胞株,培养48 h,用ELISA法检测培养液中VEGF蛋白的表达量,分析9条VEGFsiRNA序列特征与其干扰效果的关系.结果用"H-b"指数可以量化VEGF mRNA二级结构;VEGF蛋白表达的抑制程度与"H-b"指数呈负相关(r=-0.498),靶向VEGF mRNA第386～406位置核苷酸的siRNA和第401～421位置核苷酸的siRNA的"H-b"指数小,抑制蛋白表达的效果好.siRNA正义链的第19个核苷酸碱基为A/U,且第6个核苷酸碱基为A,有较好的沉默靶基因的效果.siRNA的热动力学特征也影响其干扰效果,反义链第9～14位置的内部能量稳定性的均值(AIS)大,易于发挥干扰效果;siRNA反义链的结合能量越低,siRNA反义链与靶序列mRNA结合越稳定,有利于RNA诱导的沉默复合物(RISC)剪切靶序列mRNA.结论成功地设计并合成VEGFsiRNA序列,能有效地抑制VEGF蛋白表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张洹		7	28	3.0	5.0
2	荆春霞		1	4	1.0	1.0