c血清型变形链球菌低毒力株特异DNA片段的生物信息学分析

• 作者: 史俊南 张莹 郭丽宏
• 来源期刊: 实用口腔医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 变形链球菌 测序 生物信息学 相似性检索
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 72-75
• 页数: 4页
• 分类号: R378.12|Q786
• 字数: 2721字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3733.2006.01.019

摘要

目的:发现c血清型变形链球菌低毒力株特异的新基因或已知基因的新功能,推测、鉴定基因所编码蛋白质的功能.方法:对筛选得到的26 个变形链球菌低毒力株特异的DNA片段进行序列测定,利用BLAST 2.2.6程序进行核苷酸和含6相位阅读框架编码氨基酸的相似性检索.结果:变形链球菌低毒力株特异的DNA片段大小在113～776 bp之间,平均G+C含量为38.27%,其中有8 个片段为新的基因片段,在GenBank中登记.结论:发现了8 个新的基因片段以及低毒力株特异的DNA片段的主要功能,为下一步的基因功能研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭丽宏	北京大学口腔医学院生物教研室	18	121	7.0	10.0
2	张莹	西安第四军医大学口腔医学院牙体科	7	31	3.0	5.0
3	史俊南	西安第四军医大学口腔医学院牙体科	9	28	3.0	5.0