EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片的建立及其方法学分析

• 作者: 凌志强 李沛 杨洪艳 董子明 赵继敏 黄幼田
• 来源期刊: 郑州大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 食管癌细胞 基因芯片 差异表达 基因表达谱 可靠性
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 272-274
• 页数: 3页
• 分类号: R735.1
• 字数: 2453字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6825.2006.02.027

摘要

目的:建立食管癌EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片,并对其可靠性进行验证.方法:提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA,逆转录得cDNA,再逆转录得cRNA,用Cy3-dUTP标记EC109细胞cRNA,用Cy5-dUTP标记正常食管上皮细胞cRNA,制备表达谱探针,利用该探针对EC109细胞与正常食管上皮细胞进行杂交.荧光扫描基因芯片,筛选表达谱.利用自身比较实验、重复实验和R2、一致率(CR)及假阳性率(FPR)等指标对该基因芯片系统进行方法学分析.结果:该基因芯片系统2次实验结果的符合率达85%,R2=0.7329,CR=100%.该系统的FPR为0.45%,扩增样品与无扩增样品的基因表达谱表现出较好的吻合性.结论:该芯片系统具有良好的稳定性、可靠性及低误差率等特点,可用于基因差异表达谱的分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董子明	郑州大学基础医学院病理生理学教研室	237	965	14.0	19.0
2	杨洪艳	郑州大学基础医学院病理生理学教研室	58	224	8.0	12.0
3	黄幼田	郑州大学基础医学院病理生理学教研室	73	283	9.0	14.0
4	李沛	郑州大学基础医学院病理生理学教研室	31	121	7.0	10.0
5	赵继敏	郑州大学基础医学院病理生理学教研室	61	179	7.0	8.0