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全球甲型流感病毒H5A1序列的分子进化研究
全球甲型流感病毒H5A1序列的分子进化研究
作者:
姜庆五
张文彤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甲型流感病毒
血凝素
H5亚型
进化树
进化速度
摘要:
目的 应用生物信息学数据库和工具,对现有的H5亚型甲型流感病毒全球分离株的H5A1抗原序列进化规律进行研究.方法 下载NCBI Genbank和美国洛斯阿莫斯国家实验室流感病毒数据库中全部的甲型流感病毒H5A1序列,采用快速极大似然法绘制进化树,并用SRDT模型估计各分枝的进化速度与出现时间.结果 H5A1序列的进化树可被分为两个各自独立进化的世系:美洲世系和欧/亚世系,它们在地域分布、序列位点等方面区别明显,且可被进一步细分为几大进化枝,野生禽类分枝和家禽株系分枝的进化速度存在明显差异,所有的人及其他哺乳动物感染株系则均来自于欧/亚世系的亚洲禽/人分枝.结论 H5A1序列在野生禽类中已达到相对稳定的状态,其自然变异速度为(1.990~2.535)×10-3/位点/年,而家禽中的高毒力变异株进化速度明显加快.目前威胁人类的主要是1996年之后出现的亚洲变异株,且进化树结构提示该株系出现过多次禽/人跨宿主传播事件,值得对其位点特征进行深入研究.
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相关学者/机构
相关基金
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内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
(/次)
(/年)
文献信息
篇名
全球甲型流感病毒H5A1序列的分子进化研究
来源期刊
复旦学报(医学版)
学科
医学
关键词
甲型流感病毒
血凝素
H5亚型
进化树
进化速度
年,卷(期)
2007,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
17-23
页数
7页
分类号
R373.1+3
字数
5511字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1672-8467.2007.01.005
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
姜庆五
复旦大学公共卫生学院流行病学教研室
325
3296
25.0
40.0
2
张文彤
复旦大学公共卫生学院卫生统计与社会医学教研室
27
373
10.0
19.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(8)
共引文献
(11)
参考文献
(9)
节点文献
引证文献
(1)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1988(1)
参考文献(1)
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1989(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
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1994(1)
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1995(1)
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1997(2)
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二级参考文献(0)
1998(1)
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二级参考文献(1)
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2000(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
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2004(1)
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2007(1)
参考文献(0)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
2007(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
甲型流感病毒
血凝素
H5亚型
进化树
进化速度
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
复旦学报(医学版)
主办单位:
复旦大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-8467
CN:
31-1885/R
开本:
大16开
出版地:
上海医学院路138号 285信箱
邮发代号:
4-262
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
3888
总下载数(次)
4
总被引数(次)
25666
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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