黄瓜、西瓜和南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析

• 作者: 刘晓虹 卢向阳 张海英 许亮 许勇 陈惠明
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: EIN3 基因克隆 黄瓜 西瓜 南瓜
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 668-672
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 3210字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2007.04.023

摘要

EIN3(ethylene insensitive 3)位于细胞核的核蛋白,为乙烯信号转导的下游调控基因,根据GenBank植物EIN3基因家族的保守序列设计了1对引物,以黄瓜(Cucumis sativus)、西瓜(Citrullus lanatus)和南瓜(Cucurbita maxima)总DNA为模板PCR扩增到3个725 bp的基因片段CsEIN3、ClEIN3和CmEIN3,并提交GenBank,登录号分别为AY973275、DQ023225和DQ023224.将片段序列在NCBI数据库中Blastn同源搜寻,显示151条有同源性的序列全部是EIN3基因.NCBI网站的ORF(open reading frame)Finder找到正确的开放式阅读框,翻译成为氨基酸序列,对CsEIN3、ClEIN3及CmEIN3氨基酸序列在NCBI网站进行Blastp比对,在大分子结构数据库(molecular modelling database,MMDB)搜索,3个推测蛋白保守结构域三级结构与拟南芥EIN3的DNA结合域(MMDB:30598;PDB:1WIJ)完全相同,系统进化分析表明,黄瓜、西瓜和南瓜与双子叶植物甜瓜、绿豆、蒺藜状苜蓿、烟草、番茄、拟南芥及单子叶水稻、桃红蝴蝶兰等的EIN3家族成员都有较高的相似性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢向阳	湖南农业大学生化与发酵工程实验室	252	4319	37.0	54.0
2	许勇		66	1841	27.0	41.0
3	张海英		56	1359	22.0	35.0
4	陈惠明	湖南省蔬菜研究所湖南省蔬菜工程与技术研究中心	11	151	5.0	11.0
8	刘晓虹	湖南省蔬菜研究所湖南省蔬菜工程与技术研究中心	19	197	5.0	13.0
9	许亮	湖南农业大学生化与发酵工程实验室	13	236	7.0	13.0