微型反向重复转座元件(MITE)靶区域扩增多态性:一种基于MITE的分子标记方法在水稻及其他植物上的应用

• 作者: 刘学军 孙林静 曾斌 梁永书 王春敏 王胜军 苏京平 闫双勇 马忠友
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: 微型反向重复转座元件 靶区域扩增多态性 分子标记 引物设计 水稻 棉花 番茄 拟南芥
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 459-463
• 页数: 5页
• 分类号: Q94-3|Q943|S511.03
• 字数: 3701字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-7216.2007.05.003

摘要

利用根据水稻微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable element, MITE)序列设计的特异引物,以及靶区域扩增多态性(target region amplification polymorphism, TRAP)方法中的随机引物及扩增程序对不同的水稻材料进行PCR扩增来检测MITE侧翼为基因区域的多态性,称之为微型反向重复转座元件靶区域扩增多态性(MITE-TRAP).每次扩增能产生1条或多条清晰条带,条带的大小为100～1500 bp,可在1.5%的琼脂糖凝胶上分离,有较好的可重复性,并发现了不同水稻品种间的多态性条带.进一步用基于水稻预测的MITE序列设计的特异引物对来自棉花、番茄及拟南芥的DNA样品进行MITE-TRAP扩增,均能成功扩增出条带,显示这种方法可以直接在其他植物中应用.还进一步讨论了该方法的优点及其可能的应用.