烟草基因组一类微小倒置重复转座元件(MITE)目前仍具转座活性

• 作者: Jack Chen 李婵媛 李文正 李永平 王菁菁 董海涛 钟若涵 马文广 骆红梅
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 微型反向重复转座元件(MITE) 烟草 转座 组织培养
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1157-1166
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.09.005

摘要

微小倒置重复转座元件(miniature inverted repeat transposable element,MITE)是真核基因组中含量丰富的一类非自主转座元件,且与许多重要生物学事件密切相关.目前为止,仅在极少数物种中鉴定出几个MITE家族仍具备活跃的转座活性,如此便无法充分地获知MITE转座的分子细节以解析其转座机制.本研究选择烟草(Nicotiana tabacum)基因组为研究对象,首先应用生物信息学方法分析完成了烟草MITE同源序列的种类和数量分布状况,包括MITE元件群的结构特征及相关信息;再者,通过检测MITE元件群在不同烟草品系中的多态性差异,获得其中一个元件(TMi 1)可能具有转座活性的初步证据;其后,在建立了二组适用于MITEs转座活性检测的生物学表型的基础上,采用转座子显示技术及后续验证实验,最终确认TMi 1元件于目前仍具有转座活性.这是烟草基因组中首次发现一个活跃转座的MITE,拓展了人们对具转座活性植物种类的认识范围,有助于充分认识和挖掘烟草基因组中丰富的转座子种类和资源,也为理解和定义基因组进化以及生物多样性形成的遗传规律提供有用线索.