基因芯片对骨肉瘤发病相关基因的筛查

• 作者: 张寅权 李国东 汝鸣 纪方 蔡郑东
• 来源期刊: 中国肿瘤生物治疗杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 骨肉瘤细胞 成骨细胞 基因微矩阵 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 428-434
• 页数: 7页
• 分类号: R738.1|R730.2
• 字数: 4636字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3872/j.issn.1007-385X.2007.05.006

摘要

目的: 筛查骨肉瘤发病相关的基因,探讨其对于骨肉瘤发病的意义.方法: 采用3个骨肉瘤细胞株(MG-63、Saos-2、U-2OS)及1个成骨细胞株(Hfob1.19),提取总RNA ,合成生物素标记的cRNA,与Affymetrix(R) GeneChip(R) U133A芯片杂交,筛查骨肉瘤细胞差异表达≥2.0倍的基因.挑选其中10个差异表达基因,分别设计合成引物,用嵌合荧光(SYBR(R) Green Ⅰ)实时PCR法定量检测9 例新鲜骨肉瘤标本中该10个基因的表达水平,应用ABI Prism 7 000分析其与成骨细胞株之间的表达差异.结果: 在芯片包含的所有基因(约22 000个转录本)中,3个骨肉瘤细胞株与成骨细胞株相比较,共同上调58个基因,共同下调142个基因;这些差异表达基因主要包括能量和物质代谢基因、癌基因、信号转导基因、转录相关基因、细胞周期基因、细胞凋亡基因、免疫反应基因、抑癌基因等.在200个差异表达基因中挑选10个差异表达基因,利用实时RT-PCR检测9例骨肉瘤组织标本中该10种基因的表达结果与芯片结果完全相符.结论: 骨肉瘤是一种多基因病变,应用基因芯片可以发现该肿瘤发病相关的基因,为深入探讨骨肉瘤的基因机制奠定基础.