基于克隆文库筛选的池设计

• 作者: 管宇
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 克隆文库 池设计 群试 分离矩阵 信息界
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 问题讨论
• 页码范围: 105-109
• 页数: 5页
• 分类号: O157.2|S11+9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0756.2007.01.020

摘要

池设计(pooling design)是基于克隆文库筛选(clone library screening)的一种实验设计,要求从大量的克隆体中筛选出其中含有某组特定核苷酸串的克隆体,它属于组合群试.一个池设计方案用一个二元关联矩阵(称为分离矩阵)表示,行对应于试验,列对应于克隆集合的体;考虑到生物实验存在误差,分离矩阵还需要有查错和纠错能力.利用子集或子空间之间的包含关系可以构建出分离矩阵,它的每行和每列中元素1的个数分别都一样,但试验总次数即行数明显大于信息下界.