用CPN60基因序列研究隐孢子虫种系发育关系

• 作者: 卢庆斌 娄飞 宁长申 张龙现 王进产 菅复春
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 隐孢子虫 CPN60 种系发育
• 年，卷（期）: 2007,（11）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1230-1234
• 页数: 5页
• 分类号: R382.3|S852.72+3
• 字数: 3909字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2007.11.015

摘要

本试验以编码线粒体功能性蛋白Chaperonin 60 (CPN60)的核基因作为研究对象,对隐孢子虫分离株CPN60基因进行扩增测序,用Clustal X1.81对扩增序列与GenBank相关参考序列进行比对,然后用PAUP4.0程序中邻接法(Neighbor-joining,NJ)、最大简约法(Parsimony, MP)构建基因树,同时用TREEPUZZLE程序Version 4.1构建最大似然树(Maximum likelihood, ML),以确定不同隐孢子虫虫株之间的进化关系,并以18S rRNA和HSP70基因构建的进化树作参照,评价CPN60是否更适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系的分子标记.结果显示:基于CPN60构建的进化树将隐孢子虫分为两大类:C. baileyi和C. meleagridis处于一个分枝,C. hominis、C. suis、C. parvum牛基因型和C. parvum鼠基因型处于另一个分枝上.不同隐孢子虫之间的同源性介于96%～100%,能有效区分隐孢子虫不同基因型.因此,CPN60基因序列也可作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	菅复春	河南农业大学牧医工程学院	146	712	14.0	18.0
2	张龙现	河南农业大学牧医工程学院	251	1359	18.0	24.0
3	宁长申	河南农业大学牧医工程学院	196	1115	16.0	22.0
4	卢庆斌	河南农业大学牧医工程学院	10	47	4.0	6.0
5	娄飞	河南农业大学牧医工程学院	20	47	5.0	5.0
7	王进产	河南农业大学牧医工程学院	20	106	6.0	10.0