微小隐孢子虫LDH基因的克隆与序列分析

• 作者: 付芹芹 余新炳 周天鸿 孙小会 李月琴 杨光 王穗湘 荆春霞 郭志云
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 微小隐孢子虫 乳酸脱氢酶 巢式PCR 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 1129-1133
• 分类号: R382.3
• 字数: 4477字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2010.12.012

摘要

目的 克隆微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum,Cp)南京株(NJ)乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)基因,测序并分析微小隐孢子虫NJ株CpLDH与其他隐孢子虫分离株LDH基因序列的差异.方法 根据微小隐孢子虫已知LDH 基因序列设计合成2对引物, 应用巢式PCR 技术从微小隐孢子虫NJ株基因组DNA 中扩增LDH 基因, 并将其克隆到pMD18-T 载体上,阳性克隆的重组质粒经PCR及双酶切鉴定后, 用双脱氧链终止法对重组质粒中的插入序列进行测序,应用生物信息学方法分析 CpLDH 基因序列和其他物种LDH序列的同源性.结果 巢式PCR 扩增得到特异的CpLDH 基因序列,经PCR及双酶切鉴定获得了正确的pMD18-T-CpLDH 重组质粒.测序表明, NJ株微小隐孢子虫LDH 基因全长966 bp, 编码322个氨基酸,该基因序列已登录GenBank,登录号为 HM001298.序列分析表明, 我国微小隐孢子虫NJ株与国外分离的Iowa II株 LDH基因编码的氨基酸序列具有98%的同源性.结论 成功克隆了微小隐孢子虫NJ株LDH 基因;序列测定及同源性分析表明, 微小隐孢子虫NJ株在LDH酶关键结构位点存在突变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李月琴	暨南大学生命科学技术学院	81	309	10.0	13.0
2	余新炳	中山大学基础医学院	201	1352	17.0	28.0
3	杨光	暨南大学医学院	31	186	8.0	13.0
4	荆春霞	暨南大学医学院	91	1611	22.0	37.0
5	周天鸿	暨南大学生命科学技术学院	130	517	10.0	16.0
6	付芹芹	暨南大学医学院	8	32	2.0	5.0
7	郭志云	暨南大学医学院	7	7	1.0	1.0
8	孙小会	暨南大学医学院	6	7	1.0	1.0
9	王穗湘	暨南大学医学院	8	15	2.0	3.0