微小隐孢子虫亲环素型肽脯氨酰顺反异构酶基因克隆与分析

• 作者: 付芹芹 刘国宁 孙小会 张丽菊 杨光 王穗湘 荆春霞 郭志云 陈川
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 微小隐孢子虫 亲环素型肽脯氨酰顺反异构酶基因 克隆
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 885-889
• 分类号: R382.3
• 字数: 4073字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2012.09.005

摘要

目的 克隆微小隐孢子虫(C.parvum)南京株(NJ) 亲环素型肽脯氨酰顺反异构酶基因,测序并分析C.parvum NJ株与其他隐孢子虫分离株CyP-type PPIase基因序列的差异以及亲缘关系.方法 根据GenBank上C.parvum Iowa II株CyP-type PPIase基因序列,设计2对引物,应用巢式PCR扩增目的 基因,并将其克隆入pMD18-T载体,对重组子进行双酶切和菌落PCR鉴定并测序,应用生物信息学方法分析C.parvum NJ株CyP-type PPIase基因与其它隐孢子虫株的核苷酸和氨基酸序列差异.结果 巢式PCR扩增获得特异的目的 基因,双酶切和菌落PCR鉴定获得正确的重组子,测序表明,扩增基因组DNA序列为746 bp,含有目的 基因ORF全长570 bp,编码190个氨基酸.序列分析表明,我国C.parvum NJ 株与国外分离的Iowa II 株CyP-type PPIase基因的氨基酸序列具有99%的同源性.进化树分析表明,C.parvum NJ株与Iowa II 株CyP-type PPIase基因之间的亲缘关系最近,与脑膜炎双球菌的亲缘关系最远.结论 成功克隆C.parvum CyP-type PPIase基因,C.parvum CyP-type PPIase基因在氨基酸水平高度保守.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨光	暨南大学医学院寄生虫系	31	186	8.0	13.0
2	荆春霞		91	1611	22.0	37.0
3	刘国宁	暨南大学医学院卫生学教研室	50	765	16.0	26.0
4	付芹芹	暨南大学医学院	8	32	2.0	5.0
5	郭志云	暨南大学医学院寄生虫系	7	7	1.0	1.0
6	孙小会	暨南大学医学院	6	7	1.0	1.0
7	王穗湘	暨南大学医学院寄生虫系	8	15	2.0	3.0
8	张丽菊	暨南大学医学院	5	13	2.0	3.0
9	陈川	暨南大学医学院寄生虫系	6	13	2.0	3.0