水稻基因组中抗病基因正选择方式及基因转换的研究

• 作者: 季军 杨四海 田大成
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 NBS-LRR 正选择 基因转换
• 年，卷（期）: 2007,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1856-1863
• 页数: 8页
• 分类号: S4
• 字数: 6364字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0578-1752.2007.09.002

摘要

[目的]了解正选择压力和基因转换对水稻全基因组中NBS-LRR抗病基因家族进化的影响及二者之间的相互关系.[方法]对水稻全基因组中的NBS-LRR基因进行鉴别与分类,利用PAML和GENECONV程序分别进行正选择替代和基因转换分析.[结果]在19个组(包含89个NBS-LRR基因)中检测出了显著的正选择替换位点,且约有60%正选择位点位于LRR区域;56个基因至少参与了1次基因转换事件.同时,基因转换、正选择以及基因簇之间存在明显的相关性.在84%的参与基因转换的基因中都能检测出正选择位点,且至少有84%的发生基因转换或正选择的基因都位于基因簇中.[结论]水稻基因组中的NBS-LRR基因之间,存在着频繁的正选择替代和基因转换.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨四海	南京大学生命科学学院生物系	3	27	3.0	3.0
2	田大成	南京大学生命科学学院生物系	5	152	5.0	5.0
3	季军	南京大学生命科学学院生物系	1	20	1.0	1.0