家蚕scaffold中新微卫星标记的获得与Dll基因的遗传连锁分析

• 作者: 李卫华 相辉 詹帅 赵云坡 郭秋红 黄勇平
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 家蚕 微卫星标记 Scaffold Dll基因 连锁分析
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 187-194
• 页数: 8页
• 分类号: S881.2+6
• 字数: 4089字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2007.02.005

摘要

在进行家蚕遗传连锁图谱的整合过程中,需要寻找两个作图群体中都有多态的共有标记,但这种共有标记数量较少.为此,利用已有的简单重复序列(SSR)与家蚕基因组进行比对,寻找到匹配的scaffold,再采用SSRHunter1.3搜索其中的SSR区域,排除掉原有SSR序列,选择重复次数在6～23之间的微卫星区域设计引物,用BC1群体的亲本及F1进行多态性的筛选,选择有多态性的标记用7019×(F50B×7019)BC1群体进行基因型分析.结果显示:根据原家蚕第2连锁群上SSR位点新设计的邻近的7对引物中,有6对引物在BC1群体的亲本中有多态性,选择其中2个进行遗传连锁分析,作图结果与原有相应SSR标记的作图结果基本保持一致,其中根据S0207所在scaffold上开发的NS02071和NS02072之间的图距达到6.9 cM;根据家蚕大造和C108 的回交一代初步定位的Dll基因的位置与后来在其所在scaffold上所设计的临近引物Dll1和Dll2的定位一致,且这两个标记在遗传连锁图上的图距为0.0 cM, 表明这两个标记在遗传图上的位置重叠.由此,在较短的DNA区域内(在遗传连锁图上表现1个位点)便有多个SSR标记可供使用,将为定位家蚕重要经济性状基因、分子辅助育种及功能基因研究等提供更多有价值的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李卫华	中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所	14	395	9.0	14.0
2	黄勇平	中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所	35	832	14.0	28.0
3	郭秋红	中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所	5	88	4.0	5.0
4	詹帅	中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所	5	23	3.0	4.0
5	相辉	中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所	4	243	4.0	4.0
6	赵云坡	江苏科技大学生物与环境工程学院	1	10	1.0	1.0